Вокруг собора XII в. открыты погребения XII–XVIII вв., как рядовые, в деревянных гробах, от которых сохранился только древесный тлен по краю ямы, так и исключительные, статусные погребения в каменных саркофагах. Эти саркофаги делятся на два основных типа: они бывают сборные, из 6 плит (XII–XIII вв.), и «ладьевидные» – из выдолбленного камня и долбленой крышки (XIV–XV вв.). Открыто 3 сборных саркофага и 2 ладьевидных; известно еще об одном ладьевидном саркофаге, изученном в 1960-е годы.
В одновременном храму 1179 г. притворе, о котором ничего не было известно до его археологического открытия в 2006–2008 гг., были расчищены два погребения в саркофагах из плинфы – редкость в Новгороде. Притвор был небольшим, он занимал только среднюю часть фасада, его узкие стены замыкали собой тесное пространство, но в этом тамбуре под полом или в уровне пола были сделаны исключительные погребения в каменных ящиках, сложенных из плинфы на известково-цемяночном растворе.
Такие погребения в Новгороде до этого были известны только в соборе Юрьева монастыря. Теперь мы можем утверждать, что в Новгороде существовала традиция сооружения третьего типа саркофагов, названных нами подпольными плинфяными саркофагами. Они перекрывались каменными плитами; фрагмент такой плиты мы обнаружили in situ при исследовании одного из саркофагов в притворе. Можно говорить о существовании вокруг собора и в его притворе элитарного некрополя, включавшего погребения как монахов из боярской среды, так и захоронения представителей боярских семей – вероятнее всего, ктиторов монастыря из бояр Людина конца.
