Синтрон был расписан по внешней поверхности; роспись изображает полилитию, то есть плиты полированного мрамора с разными прожилками. К западу от синтрона в 2011 г. были обнаружены ранее неизвестные детали внутреннего убранства храма: основания позднего иконостаса и более ранней алтарной преграды под ним, а также нижняя часть белокаменного престола с основаниями четырех белокаменных ножек и каменный омфалий. Престол, по всей вероятности, не одновременен храму, а создан вместо более раннего (возможно – с использованием плит прежнего) во время первой перестройки интерьера в начале XIII в. Омфалий же достоверно принадлежит середине XII в., он вложен в известковую подготовку первоначального пола.
На пространстве наоса храма в траншеях и в средней части были выявлены прослойки песка, перекрывающие остатки заливки первоначального пола. Этот плотный слой белого цвета, состоящий из известкового раствора с примесью песка, лежит прямо на горизонте мерянского селища – культурного слоя финно-угорского поселка, существовавшего здесь в первом тысячелетии нашей эры (VIII–X вв.).
На заливке древнего пола, середины XII в., в центре подкупольного пространства первоначального храма, то есть прямо под куполом когда-то бывшего храма, лежит крупный белый камень круглой формы, имеющий легкий розоватый оттенок. Это и есть омфалий («пуп») – особое место, которое в древнерусских источниках называется «место среди церкви».