Ответом археологии на новые вызовы стало совершенствование методов полевых работ, внедрение новых приемов изучения культурного слоя, сбора находок и палеоэкологических материалов, привлечение естественных наук к анализу и интерпретации археологических данных и изучению палеосреды. Обновление методического арсенала российской археологии и практических приемов полевых и лабораторных работ началось в 1990-х гг., но его эффект в изучении средневекового прошлого в полной мере проявился в первое десятилетие XXI века. Одним из существенных аспектов этого обновления стало использование новых технических средств для фиксации процесса раскопок и их результатов, позволяющее точно передать особенности древних памятников, продлить их жизнь в архивной документации и проследить значимые для их понимания детали, которые не видны невооруженным глазом.
Изменения затронули и другие аспекты средневековой археологии. Археологическая галерея средневековой Руси постепенно пополнилась новыми типами и категориями памятников, которые ранее были малоизвестны науки. Долгие десятилетия основными объектами раскопок, воспринимавшимися как значимые источники новой информации о русском средневековье, оставались курганные могильники, культурный слой средневековых городов, городища и, в меньшей степени, селища (неукрепленные поселения). Но в конце XX в. в поле зрения археологии оказались и иные категории памятников: пахотные горизонты средневековых полей, производственные зоны поселений, участки влажного культурного слоя с хозяйственными объектами, многообразные типы погребальных памятников, включая трудноуловимые могильники с остатками кремаций, помещенными на поверхности земли, позднесредневековые монастырские некрополи, инженерные сооружения, места полей сражений.
