Из агронома-опытника Т.Д. Лысенко превращается в создателя особого учения, известного уже в 1930-е гг. под именем «мичуринской биологии» и «творческого советского дарвинизма». Очень скоро это приводит к конфронтации с генетиками, отстаивавшими, по утверждению Лысенко, неизменность признаков и неверно ориентировавшими сельскохозяйственную науку. Огульное отрицание лысенковцами данных современной экспериментальной науки становится очевидным уже в дискуссиях с генетиками на Четвертой сессии ВАСХНИЛ (1936) и на специальном совещании, созванном в 1939 г. редакцией журнала «Под знаменем марксизма». Распространению идей Лысенко немало способствовали смещение в 1935 г. Н.И. Вавилова с поста президента созданной им ВАСХНИЛ и арест его в 1940 г. Последние годы активной деятельности Вавилова были отравлены Лысенко, вмешивавшимся в его научную работу, требовавшим перестроить селекционные исследования на основе мичуринской биологии и отречься от «формальной генетики». С середины 1930-х гг. Лысенко опирается на растущую поддержку Сталина, и, как показывают архивные разыскания последних лет, поддержка эта основывается на вере Сталина в его таланты как агронома-практика и селекционера.
В 1940 г. Т.Д. Лысенко делает своим знаменем ламаркизм, объявляя его «хорошим и правильным учением», и тем самым решительно выходит за рамки собственно сельскохозяйственной науки, претендуя на идейное руководство биологией в целом. Выступая в качестве теоретика, он отвергает не только генетику, но и дарвиновское положение о внутривидовой конкуренции как важнейшем факторе эволюции. На конференциях, состоявшихся в 1947 г. в МГУ и в Отделении биологических наук АН СССР, представления Лысенко подвергаются аргументированной критике, а в апреле 1948 г. против них выступает заведующий отделом науки ЦК ВКП(б) Ю.А. Жданов. Узнав о несанкционированном Политбюро выступлении Жданова, Лысенко решает поддержать сам Сталин. 15 июля Совет Министров СССР назначает 35 новых членов ВАСХНИЛ, обеспечивая «мичуринцам» перевес над сторонниками генетики, а 31 июля – 7 августа проходит сессия ВАСХНИЛ, на которой Лысенко выступает с программным докладом «О положении в биологической науке». Как стало известно в 1990 г., текст доклада был отредактирован лично Сталиным. Сессия знаменовала не только «идейный разгром» генетики – использовавшаяся терминология во многом воспроизводила язык партийных съездов, – но и разгром организационный. Специальными решениями Президиума АН СССР, АМН СССР, ВАСХНИЛ, приказами министерств высшего образования и здравоохранения СССР из научных и учебных учреждений было уволено несколько тысяч ученых и преподавателей – «менделистов-морганистов» и «вейсманистов».
