Одновременно продолжается большая напряженная работа ученого. На протяжении многих лет он читает спецкурсы на филологическом факультете МГУ («Язык Н.В. Гоголя», «Язык Толстого», «Язык М.Ю. Лермонтова» и др.). Проблемы языка художественной литературы и стиля писателя нашли отражение в его трудах: «Гоголь и натуральная школа» (1925), «О художественной прозе» (1930), «Язык Пушкина. Пушкин и история русского литературного языка» (М.; Л., 1935), «О языке Толстого» (1939), «Стиль прозы Лермонтова» (1941), «Стиль Пушкина» (1941), «Язык и стиль басен Крылова» (1945) и др. Работы по теории стилистики и поэтики были объединены в публикации «Стилистика. Теория поэтической речи. Поэтика» (1963), которая и сегодня остается настольной книгой для специалистов и студентов. В 1934 г. Виноградов публикует «Очерки по истории русского литературного языка XVII–XIXвв.», вышедшие в 1938 г. вторым изданием. В этой работе он показал процесс развития общенационального русского языка во всем многообразии его стилей, дал анализ языка отдельных писателей, показал роль выдающихся ученых, публицистов и великих писателей в развитии русского литературного языка в области лексики, фразеологии, грамматики и стилистики. По обилию привлеченного материала, по мастерству анализа языка писателей, а также по продуманности концепции развития стилей литературного языка эти «Очерки» являются выдающейся работой по истории русского литературного языка. В годы Великой Отечественной войны Виноградов выступает в печати со статьями о величии русского языка, о значении его в жизни советского многонационального государства («Величие и мощь русского языка» – 1944 г., «Великий русский язык» – 1945 г.).
Академик В.В. Виноградов принадлежал к числу тех лучших представителей русской интеллигенции, которых не миновала судьба, уготованная им тогдашним политическим режимом. Дважды он был в ссылках; уже вернувшись, после войны, он испытал гонения, которые обрушили на него сторонники марровского так называемого «нового учения о языке»; вопреки здравому смыслу его пытались даже обвинить в «космополитизме»»; он был «виноват» лишь в том, что знал и ценил работы зарубежных ученых и не считал себя вправе обходить их молчанием в своих исследованиях. В 20-х, 30-х, 40-х гг. условия жизни, в которых работал Виноградов, были далеки от тех, которые способствовали бы творческому труду: ученый часто не имел даже бумаги и писал на клочках оберток, на обрывках школьных тетрадей. Напряженная работа ученого вопреки всему не прошла незамеченной. В 1946 г. его избирают академиком АН СССР, в 1950 г. он – член Президиума АН СССР и академик-секретарь Отделения литературы и языка АН СССР (до 1963 г.). Его назначают директором Института языкознания, а затем – Института русского языка АН СССР, который он возглавлял до 1968 г.