Академику Колчанову Николаю Александровичу - 75 лет!
09.01.2022
Юбилей академика Колчанова Николая Александровича
Академик
Колчанов Николай Александрович
![Академик Колчанов Николай Александрович](/FStorage/Download.aspx?id=857dfff5-e492-4d6b-ad8b-51398c01ef24)
Николай Александрович Колчанов родился 9 января 1947 года в с. Кондрашино Знаменского района Омской области.
В 1971 году окончил Новосибирский Государственный Университет по специальности «Биология». Далее весь трудовой и творческий путь — в Институте цитологии и генетики СО АН СССР (ИЦиГ СО АН), с 1992 г. – ИЦиГ СО РАН, а с 2013 г. — ФИЦ ИЦиГ СО РАН (Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН): аспирант (1971-1974), младший научный сотрудник, старший научный сотрудник Лаборатории генетики популяций (1975-1988), зав. Лабораторией теоретической молекулярной генетики (1988-1992), заместитель директора по научной работе (с 1992-2007), врио директора с 2007 года, с 2008- по 2014 гг. — директор ИЦиГ СО РАН, в 2015 – 2017 гг. – директор Федерального исследовательского центра Институт цитологии и генетики СО РАН, а с 2018 года — научный руководитель ФИЦ ИЦиГ СО РАН и заведующий Отделом системной биологии.
Член-корреспондент РАН c 2003 года, академик РАН c 2008 года — Отделение нанотехнологий и информационных технологий.
Академик Н.А. Колчанов — основатель российской биоинформатики и системной компьютерной биологии, стоявший у истоков их бурного развития в новосибирском Академгородке. Область научных интересов: реконструкция, компьютерный анализ и моделирование структурно-функциональной организации и эволюции генных сетей, геномов, генов, РНК, белков человека, животных, растений и микроорганизмов на основе методов биоинформатики и системной компьютерная биология.
Он является автором и соавтором около 700 публикаций в отечественной и зарубежной печати, в том числе — 9 монографий, 4 учебных пособия, 18 авторских свидетельств и 8 патентов. Широкое признание получили его исследования в таких областях как компьютерный анализ молекулярных механизмов мутагенеза и регуляторных механизмов, контролирующих экспрессию генов, реконструкция, анализ и моделирование генных сетей и молекулярно-генетических систем.
В 1975 году получил степень кандидата биологических наук (тема диссертации - Исследование ренин-ангиотензинной системы на основе математического и экспериментального моделирования)». В 1989 году получил степень доктора биологических наук (тема диссертации «Теоретическое исследование закономерностей структурно-функциональной организации и эволюции генетических макромолекул»).
Н.А. Колчанов совместно с соавторами разработал компьютерные базы данных по структурно-функциональной организации регуляторных геномных последовательностей, компьютерные методы их анализа и распознавания. внёс существенный вклад в разработку теории анализа генетических текстов и создание новых методов компьютерного исследования структурно-функциональной организации и эволюции геномов. Это позволило ему теоретически обосновать распространенность конвергентного возникновения сходства на уровне геномных структур в ходе их эволюции.
Н.А. Колчанов создал компьютерные методы исследования молекулярных механизмов мутационного процесса и на их основе провел глубокий теоретический анализ роли нуклеотидного контекста в возникновении спонтанных, индуцированных и соматических мутаций. Сформулировал концепцию зависимости мутационного процесса в геномах про- и эукариот от контекстных и структурных особенностей ДНК. Им были разработаны математические модели, позволившие исследовать динамику численности и внутригеномной дивергенции перемещающихся последовательностей в геномах эукариот, и впервые получены оценки параметров внутригеномной транспозиции перемещающихся последовательностей в геноме человека. На этой основе Н.А. Колчанов обосновал положение о том, что транспозиция перемещающихся последовательностей является важным источником генерации генотипической изменчивости в популяциях человека и сформулировал концепцию, акцентирующую внимание на мобильных генетических элементах как факторе, обеспечивающем невырождение популяций при эволюции в изменяющихся условиях среды.
Первостепенное значение имеют выполненные под руководством Н.А. Колчанова работы по созданию программно-информационных комплексов для решения широкого спектра задач биоинформатики и системной компьютерной биологии, включая: (i) программно-информационную систему для реконструкцию генных сетей и метаболических путей на основе автоматического извлечения знаний о генах, молекулах РНК, белках, метаболитах и их межмолекулярных взаимодействиях из научных публикаций, патентов и фактографических баз данных с использованием методов машинного обучения; (ii) комплексы методов для анализа и структурно-функциональной аннотации геномных последовательностей, распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов в геномной ДНК и количественной оценки влияния мутаций на эффективность их функционирования; (iii) методы анализа транскриптомных данных, включая вычислительные конвейеры для оценки экспрессии генов, выявления генов миРНК, функциональной аннотации транскриптов; (iv) пакеты программ для решения задач компьютерной протеомики, включая предсказание функции, структуры и иммунологических свойств белков, предсказания функциональных сайтов в 3-D структуре белков, анализа взаимосвязи структура-активность белков, поиска новых фармакологических мишеней в пространственной структуре белков; (v) пакеты программ для анализа молекулярной эволюции генных сетей и их базовых компонент – генов, РНК и белков; (vi) методы компьютерного анализа и моделированя генных сетей, контролирующих морфогенез растений; (vii) широкий спектр методов для высокопроизводительного автоматического фенотипирования (морфометрии) растений на основе методов машинного обучения; (viii) пакеты программ для многоуровневого компьютерного моделирования сложных молекулярно-генетических систем и процессов, контролирующих жизненно важные функции одноклеточных организмов, а также ансамблей клеток, тканей и органов у животных и растений; (ix) методы агентного моделирования микробных сообществ, учитывающие молекулярно-генетические процессы внутри клеток и сигнальные и трофические взаимодействия между клетками; (x) комплексы программ для компьютерной поддержки дизайна искусственных бактериальных молекулярно-генетических конструкций с заданными свойствами).
Н.А. Колчанов — член Бюро Отделения нанотехнологий и информационных технологий РАН, член Совета РАН по генно-инженерной деятельности, член Научного совета РАН по биотехнологии, член Президиума СО РАН, заместитель председателя Научного совета РАН по генетике и селекции, член Бюро Объединенного ученого совета СО РАН по биологическим наукам, заместитель председателя Ученого Совета ИЦиГ СО РАН, председатель Научного совета СО РАН по биоинформатике, член совета по супервычислениям СО РАН, вице-президент Центрального Совета Вавиловского общества генетиков и селекционеров, член Межакадемического Совета по проблемам развития Союзного государства (Российская часть).
Н.А. Колчанов с 1995 по 2003 год — преподаватель Кафедры цитологии и генетики Факультета естественных наук (ФЕН) НГУ, с 2003 г. — заведующий и профессор Кафедры информационной биологии ФЕН НГУ; заместитель председателя Диссертационного Совета ИЦиГ СО РАН по защитам кандидатских и докторских диссертаций, член Ученых советов ФЕН НГУ и Медико-биологического факультета НГУ. Н.А. Колчанов являлся научным руководителем 12 кандидатских диссертаций, а также научным консультантом 2 докторских диссертаций. Его ученики, работающие в России и других странах, являются гордостью российской науки и определяют мировой уровень развития современной биоинформатики.
Н.А. Колчанов — член редколлегий журналов «Генетика», «Сибирский экологический журнал», «Экологическая генетика», «Наука из первых рук», «Биотехнология и селекция растений», «Вавиловский журнал генетики и селекции» (зам. главного редактора), «Mathematical Biology and Bioinformatics» (зам. главного редактора), «International Journal of Molecular Sciences».
С 1998 года по настоящее время Н.А. Колчанов является организатором и бессменным председателем Международной мультиконференции по биоинформатике регуляции и структуры геномов\системной биологии (BGRS\SB), представляющей собой один из крупнейших международных научных форумов, в работе которого принимают участие ведущие ученые и научные центры России и мира.
Награжден орденом Дружбы (2017 г.).
Лауреат премии им. А.А. Баева (1995 г.) Российской государственной научно-технической программы «Геном человека».
Удостоен почетного звания «Заслуженный ветеран СО РАН».