избран почетным членом Болгарской академии наук (18).
С 1946 г. Академия наук присуждает Премию имени Комарова за выдающиеся работы в области ботаники: систематики, анатомии и морфологии растений, ботанической географии и палеоботаники.
В 1948 г. поселок Келломяки под Ленинградом в честь ученого переименован в Комарово.
В разные годы у В.Л. Комарова учились: А.С. Бондарцев, В.А. Бриллиант, В.Н. Васильев, И.Т. Васильченко, Н.Н. Воронихин, М.М. Голлербах, Б.Н. Городков, А.А. Еленкин, А.П. Ильинский, Б.А. Келлер, Е.М. Лавренко, В.П. Малеев, Б.Н. Овчинников, Н.В. Палибин, Л.Ф. Правдин, К.А. Рассадина, С.Я. Соколов, В.Н. Сукачев, Б.А. Тихомиров, В.Г.  Траншель, В.В.  Уханов, Б.А.  Федченко, А.П.  Шенников, Б.К.  Шишкин, М.Я.  Школьник, П.А.  Якимов, Д.Е.  Янишевский и др.
Умер В.Л.  Комаров 5 декабря 1945  г. в Москве, похоронен на Новодевичьем кладбище.
Семья: первая жена – Мария Романовна Комарова (1886(?)  г.р.), вторая жена – Надежда Викторовна Комарова (урожд. Старк, 1890–1962).
Ст.н.с. Архива РАН Г.И. Савина