В соответствии с исторически сложившимся статусом и задачами Академия построена по научно-отраслевому и территориальному принципу и включает 13 отделений РАН (по областям науки и направлениям науки) и 3 региональных отделения РАН.
Для каждого отделения приведен список научных организаций, находящихся под научно-методическим руководством отделения.
Научно-методическое руководство научными организациями регионов страны осуществляется Отделениями РАН во взаимодействии с региональными отделениями РАН:
 | Отделение математических наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение физических наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение нанотехнологий и информационных технологий РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение энергетики, машиностроения, механики и процессов управления РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение химии и наук о материалах РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение биологических наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение физиологических наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
|
|
 | Отделение наук о Земле РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение общественных наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение глобальных проблем и международных отношений РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение историко-филологических наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение медицинских наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |
 | Отделение сельскохозяйственных наук РАН > ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ Научные организации, находящиеся под научно-методическим руководством Отделения |