Отдел образован в 1994 г. Руководитель отдела - доктор физ.-мат. наук, профессор Томилин Александр Николаевич (Лауреат Государственной премии СССР, активный участник разработки высокопроизводительных отечественных вычислительных систем и их системного программного обеспечения), ведущие научные сотрудники - доктор технич. наук Кузнецов Сергей Дмитриевич (российский лидер исследований и разработок систем управления базами данных, главный и научный редактор российских журналов по информатике), кандидаты физ.- мат. наук Бурдонов Игорь Борисович, Косачев Александр Сергеевич. Томилиным А.Н., Кузнецовым С.Д., Бурдоновым И.Б., Косачевым А.С. разработаны операционные системы высокопроизводительных отечественных ЭВМ и комплексов, в том числе для работы в системах реального времени.