Научные интересы: фундаментальные исследования в области геохимии изотопов углерода, органической геохимии, геологии и геохимии нефти и газа, происхождения алмазов; выдвинул и обосновал новую концепцию происхождения и эволюции жизни, возникновения системы Земля-Луна, инициатор и руководитель программ исследования Луны ("Луна-Глоб") и возврата вещества с Фобоса ("Фобос-Грунт"). Э. Галимов – участник и руководитель морских экспедиций на суднах «Академик Борис Петров» (1990, 1997, 2006), «Зонне» (1992), «Джоидес Резольюшен» (1991), «Гломар-Челленжер» (1976) и др. Автор более 500 научных публикаций: Concept of Sustained Ordering and ATP-related Mechanism of Life’s Origin. Int. J. Molecular Sciences (2009), Advances in geochemistry during the last four decades: A personal perspective. Applied Geochemistry (2009), Замыслы и просчеты, Фундаментальные космические исследования в России последнего двадцатилетия Двадцать лет бесплодных усилий. Монография (2010); Научное обоснование проекта доставки грунта с Фобоса. Астрономический Вестник (2010) и др. Обладатель премии им. В.И. Вернадского за серию работ по биологическому фракционированию изотопов и разработку изотопных методов решения задач нефтегазовой геохимии (1984), межд. медали Альфреда Трейбса за выдающийся вклад в органическую геохимию (2004), ордена "Знак Почета"(1986, 1994), ордена Почета (1999). Ключевые слова Геохимия стабильных изотопов, геохимия углерода, геохимия органического вещества.