Политико-военные, социально-экономические и технологические аспекты международной и национальной безопасности, стратегическая стабильность. Профессор факультета мировой политики МГУ им. М.В.Ломоносова, декан этого факультета. Директор Института проблем международной безопасности РАН. Председатель Совета по проблемам международной безопасности при Отделении общественных наук РАН. Член Научного совета РАН по комплексной проблеме «Гидрофизика». Член Научного совета Совета безопасности Российской Федерации. Член наблюдательного совета Госкорпорации «Роснано». Председатель Российской ассоциации инновационного развития (РАИР) Автор более 160 научных трудов, в том числе 23 монографий (из них 7 в соавторстве). В т.ч.: «США в системе международных отношений в 1980-е годы» (1984); «Космическое оружие: дилемма безопасности» (в соавторстве, 1985); «Армия и политика. Эволюция советской военно-политической и военно-стратегической мысли, 1918-1991 годы» (1995) (издана также в США в 2007); «Путь России в глобальной экономике» (1999); «Промышленная политика и национальная безопасность» (2001, соавт.) «Стратегическое управление: теория, исторический опыт, сравнительный анализ, задачи для России» (2003) (издана также в КНР в 2005); «Политология и социология военной стратегии» (2005); «Реальный суверенитет в современной мирополитической системе» (2006); «О стратегическом планировании в политике» (2007); «Очерк политики как феномена общественной жизни» (2008); «Обеспечение стратегической стабильности в прошлом и настоящем» (2009); «Политика как общественный феномен: Формы и виды политики, ее акторы, взаимоотношения с идеологией, военной стратегией и разведкой» (2010). Многие труды А.А.Кокошина опубликованы за рубежом. Удостоен наград: орден «Знак Почета», орден Почета, орден Дружбы, орден «За заслуги перед Отечеством» IV (1997) и III (2005) степеней, орден «Содружество» Парламентской ассамблеи СНГ (2007), почетный знак Государственной Думы ФС РФ «За заслуги в развитии парламентаризма», медалями и почетными знаками Совета безопасности РФ, Министерства обороны РФ, Федеральной службы безопасности РФ, Федеральной пограничной службы РФ.