Область научных интересов - систематика, эволюционная морфология и экология млекопитающих горных территорий. Основным научным направлением деятельности Темботовой Ф.А. является изучение закономерностей формирования биологического разнообразия на базе учения о высотно-поясной структуре экосистем Кавказа, разработанного чл.-к. РАН А.К. Темботовым (Темботов, 1972-2004). Темботова Ф.А. в 2004 г. избрана директором Института экологии горных территорий Кабардино-Балкарского научного центра РАН (ИЭГТ КБНЦ РАН). Член Президиума КБНЦ РАН, Бюро Териологического научного общества, Совета по особо охраняемым территориям Северного Кавказа, председатель Ученого совета ИЭГТ КБНЦ РАН. Темботова Ф.А. являлась: главным редактором сборников трудов ИЭГТ; ответственным редактором материалов конференций: «Млекопитающие горных территорий» и «Горные экосистемы и их компоненты»; членом редколлегии журнала «Известия КБНЦ РАН». С 2004 г. руководит проектами по программами Президиу-ма РАН и ОБН РАН. С 1993 по 1998 гг. преподавала на кафедре Общей биологии и гистологии Кабардино-Балкарского госуниверситета, с 2000 г. является профессором кафедры зоологии факультета естествознания Адыгейского госуниверситета. Вела спецкурсы на биологическом факультете Абхазского госуниверситета. С момента открытия в ИЭГТ в 2003 г. отдела аспирантуры является руководителем 7 аспирантов и 2 соискателей. Ею опубликовано около 100 научных публикаций, в том числе 5 монографий и учебно-методических пособий. Основные из публикаций: «Насекомоядные Кавказа», «Ежи Кавказа», «Проблемы экологии горных территорий» (Учебное пособие). Темботова Ф.А. заслуженный деятель Кабардино-Балкарии. Ключевые слова Систематика. Эволюционная морфология. Экология млекопитающих.