Научные интересы: фундаментальные проблемы археологии, ритмы и динамика развития дописьменных культур, история технологий, древнейшее горно-металлургическое производство на территории Евразии. Е.Н. Черных был организатором и принимал активное участие в археологических и геолого-археологических экспедициях по многим регионам Евразии: в Монголии и Забайкалье, на Алтае и на Памиро-Тяньшане, в пустынных областях Средней Азии, на Урале, в Северном Причерноморье, на Северном и Южном Кавказе, в Малой Азии, на Балканах. Результатами экспедиций стало открытие многих ярких памятников горно-металлургического производства; среди последних – горно-металлургический центр Каргалы на Южном Урале и медный рудник V тыс. до н.э. Аи бунар на Балканах признаны научной общественностью весьма значимыми на мировом уровне. Автор около 500 печатных работ, среди которых – 20 книги. Статьи и книги опубликованы не только в России, но в разных странах Европы и Азии. Научная, научно-педагогическая и административная деятельность: с 1884 по наст.вр. является заведующим лабораторией естественнонаучных методов Института археологии РАН; член ряда Ученых советов; читал общие и специальные курсы по археологии во многих отечественных вузах, ряда европейских стран, а также США; исполняет обязанности заместителя Председателя экспертного совета отдела «Естественнонаучные методы » Российского фонда фундаментальных исследований. Важнейшие научные труды автора за последние 10 лет: – «Каргалы: древнейший горно-металлургический центр Северной Евразии». Тома I–V (Е.Н. Черных – автор, научный редактор и составитель). М.: Языки славянской культуры, 2002–2007 (общий объем – более 130 авт.л.); – «Степной пояс Евразии: феномен кочевых культур». М.: Рукописные памятники Древней Руси, 2009 (50 авт.л.); – «Древняя металлургия Северной Евразии» (на китайском языке); A Series of Studies on Turfan. Beijing: 2010 (35 авт. л., соавтор С.В Кузьминых); "Культуры номадов в мегаструктуре Евразийского мира". М.: Языки славянской культуры, 2013 год в двух томах (около 70 авт. листов). Награды: правительством Болгарии награжден орденом Кирилла и Мефодия I степени (1980); премия Отделения историко-филологических наук РАН имени академиков В.П. Алексеева и Т.И. Алексеевой (2009). Ключевые слова История естествознания и техники