времени руководству Академией наук. Ее повседневной жизнью управляли вице-президент В.Я. Буняковский и непременный секретарь К.С. Веселовский, докладывавший Общему собранию о принятых Толстым решениях по тому или иному вопросу академической жизни. Между учеными и президентом возникало немало конфликтов. Как министр внутренних дел Толстой опротестовывал выборы неугодных новому руководству академиков, всячески создавая препоны для работы либеральных ученых. Он тормозил подготовку нового Устава Академии. Это вызывало недовольство части членов Академии.
Тем не менее, Толстой сделал немало полезного для Академии наук. Он стремился улучшить положение Библиотеки и академической Типографии, расширил помещения последней, добился финансирования реконструкции зданий Пулковской обсерватории и приобретения новых специальных астрономических инструментов, способствовал публикации многочисленных рукописных памятников по русской истории и культуре. Президент содействовал научным поездкам русских ученых за рубеж для научных занятий. Именно Д.А. Толстой был инициатором создания комиссии под председательством А.Ф. Бычкова, начавшей подготовку и издание «Писем и бумаг императора Петра Великого».
Сам он занимался изучением истории Академии наук и образования в XVIII в. и в 1885 г. опубликовал работы «Академическая гимназия в XVIII столетии» и «Академический университет в XVIII столетии». Эти исследования были посвящены изучению истории от зарождения этих учреждений, одновременно с Академией наук, до директорства Е.Р. Дашковой. Данные работы были одной из первых попыток в нашей историографии глубокого исследования истории Академии наук. Они были написаны на основе документов академического Архива, большим знатоком которых был Д.А. Толстой. Не менее значимы были и другие труды Д.А. Толстого в области истории образования, например, «Городские училища в царствование Императрицы Екатерины II» (1886). В целом его научное наследство