Коллекции, собранные и описанные самим Мессершмидтом, поступили в Кунсткамеру в 1729 году. Они включали растения с подробными описаниями и ссылками на Турнефора; животных с разделением на 9 классов: насекомые, моллюски, панцирные, ракообразные, змеи, рыбы, китообразные, птицы и четвероногие. В описаниях Мессершмидт дает название на латыни, по-русски, по-немецки, по-английски, на тангутском, монгольском языках. Собранные минералы распределены на 6 классов: вода, земля, сера, соль, металлы, камни. Большое значение для академического музея имели археологические предметы, привезенные Мессершмидтом, так как он их не только покупал, но и сам занимался раскопками, с указанием в дневнике, где и при каких обстоятельствах, на какой глубине они были проведены.
Собранные Д.Г. Мессершмидтом материа-лы, их описания, выполненные самим ученым, имели большое значение для ботанических, зоологических, археологических, этногра-фических, лингвистических исследований, проводимых в Академии наук.