В одной из частных коллекций выделил ботанические собрания, особенно семян. Задачей Шумахера было не только знакомство и описание посещаемых им музеев, но и приобретения для петровской Кунсткамеры. В Амстердаме он встретился со старыми знакомыми Петра: у С. Схейнфута купил полное собрание конхилиев (т.е. раковин улиток), минералов и рисунков; у А. Себы ничего не купил, но записал, что его кабинет «превосходит в анималиях и минералах». Известный Петру еще по первому заграничному путешествию кабинет Якоба де Вильде продавался, и Шумахер в отчете подробно этот кабинет описывает. Посетил он и старого профессора Фр. Рюйша, отметив, что «нынешние препараты не в полу так хороши суть», как те, что были изготовлены раньше. Поэтому анатомическое собрание, которое имелось уже у Петра, ничто и никто превзойти уже не может.
Шумахер побывал и осмотрел публичные и частные собрания в Лейдене, Утрехте, Дельфте, Саардаме, Гааге. То, с каким знанием И.Д. Шумахер судит о самых разных собраниях, свидетельствует о том, что, работая в петербургской Кунсткамере, он к 1721 г. уже был знаком с анатомическими, зоологическими, ботаническими собраниями, коллекциями минералов, антиков, монет, медалей, живописи. Так, в Антверпене в одном из собраний он отметил особо картины Рубенса, Микеланджело, Ван Дейка, Пуссена. Помимо этого, ему было поручено смотреть, приобретать и заказывать научные инструменты. Прибыв в Париж, он осмотрел обсерваторию и находящиеся там инструменты и машины: «На обсерватории обретаются модели, инструменты математические и физические», которые Шумахер велел срисовать и описать. В Амстердаме у известного мастера Питера Мушенбрука (Petrus van Musschenbroek) он приобрел камеру обскуру, латерну магику, измерительные инструменты, которые поправил известный голландский физик профессор Схравезанд. Увидев в книге Схравезанда рисунки машин «к экспериментам механическим, статическим, гидростатическим, физическим и оптическим», дальновидный Шумахер действовал как опытный менеджер: «…многие монархи оные машины
